Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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