Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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