Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms