Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NICN1Q9BSH3 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms