Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms