Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HDAC11Q96DB2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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