Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SCG3Q8WXD2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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