Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD55Q3KP44 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms