Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYT16Q17RD7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT16Q17RD7 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms