Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms