Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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