Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IFFO1Q0D2I5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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