Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms