Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms