Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms