Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRE11P49959 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRE11P49959 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRE11P49959 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRE11P49959 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRE11P49959 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRE11P49959 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRE11P49959 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms