Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms