Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK8P49336 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms