Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms