Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms