Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms