Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms