Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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