Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC175P0C221 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms