Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms