Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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