Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PLXND1Q9Y4D7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms