Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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HDAC6Q9UBN7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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