Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms