Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms