Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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