Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms