Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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