Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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