Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms