Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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