Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms