Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JAG1P78504 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JAG1P78504 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JAG1P78504 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JAG1P78504 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms