Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms