Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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