Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB3P54284 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms