Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA4P51532 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms