Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
APOBEC1P41238 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms