Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms