Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CTRB1P17538 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CTRB1P17538 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTRB1P17538 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CTRB1P17538 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CTRB1P17538 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTRB1P17538 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTRB1P17538 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CTRB1P17538 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTRB1P17538 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTRB1P17538 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CTRB1P17538 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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