Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM2P07951 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM2P07951 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM2P07951 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM2P07951 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM2P07951 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPM2P07951 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPM2P07951 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPM2P07951 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPM2P07951 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms