Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LTAP01374 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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LTAP01374 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LTAP01374 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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