Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms