Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms