Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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